Pseudomonas i afføringen henviser til tilstedeværelsen af bakterier fra Pseudomonas-slægten, oftest Pseudomonas aeruginosa, i mave-tarmkanalen. Selvom det normalt ikke er en almindelig tarmbeboer, kan det forårsage infektion eller overvækst, især hos personer med svækket immunsystem. Dets påvisning kan indikere en ubalance i tarmens mikrobiota eller en underliggende tilstand, især hvis der er tilstedeværelse af mave-tarmsymptomer.
Forhøjede niveauer af Pseudomonas-arter kan forekomme ved betændelse i tarmen. Forhøjede niveauer kan føre til diarré og løs afføring.
Test for Pseudomonas i afføringen er gavnlig for personer med vedvarende gastrointestinale problemer, især hvis de er immunkompromitterede eller har været på hospitalet for nylig. Dette omfatter patienter med kroniske tarmsygdomme, dem, der for nylig har gennemgået antibiotikabehandling, og personer med en historie med hospitalserhvervede infektioner.