SOX2, forkortelse for SRY (Sex Determining Region Y)-Box 2, er en central transkriptionsfaktor involveret i embryonal udvikling, stamcellspluripotens og vævshomeostase. SOX2 befinder sig primært i cellekernen og regulerer genekspression ved at binde sig til specifikke DNA-sekvenser og kontrollere målgeners aktivitet. Den spiller en væsentlig rolle i at opretholde stamcellers pluripotens og selvfornyelse og arbejder sammen med andre transkriptionsfaktorer som OCT4 og NANOG for at danne et kernenetværk, der bevarer den udifferentierede tilstand i embryonale stamceller.