Tarm-markører

Acinetobacter spp. er en gruppe gram-negative bakterier, som almindeligvis findes i jord, vand og nogle gange i den menneskelige tarm. Selvom de normalt ikke dominerer i en sund mikrobiom, kan visse stammer kolonisere tarmene, især efter antibiotikabehandling eller i hospitalsmiljøer. Nogle arter, såsom Acinetobacter baumannii, er kendt for deres resistens over for antibiotika og deres rolle i infektioner, især hos immunkompromitterede personer. Ved afføringsanalyse kan tilstedeværelsen af Acinetobacter afspejle miljømæssig eksponering, mikrobiologisk ubalance eller antibiotikarelaterede ændringer i tarmfloraen.

Akkermansia muciniphila er en tarmbakterie, der understøtter vedligeholdelsen af tarmens slimhinde og en sund tarmvæg. Den er forbundet med gavnlige metaboliske og immunologiske effekter og kan spille en vigtig rolle for tarmens sundhed, vægtregulering og generelle velvære.

Alpha-1 antitrypsin (AAT) er et protein, der hovedsageligt produceres af leveren, og som hjælper med at beskytte lungerne og andre organer mod enzymer, der forårsager inflammation. Måling af AAT-niveauer i afføring kan hjælpe med at påvise intestinalt protein tab og inflammation, hvilket understøtter diagnosen af mave-tarm-sygdomme såsom inflammatorisk tarmsygdom og protein-tabende enteropati.

Ammoniak er en kvælstofholdig forbindelse, der dannes i tarmen gennem nedbrydning af proteiner og aminosyrer af bakterier i tarmen. I en sund tarm bruges det meste ammoniak enten af mikrober eller absorberes og afgiftes af leveren. Forhøjede niveauer af ammoniak i afføringen kan indikere overdreven proteinfermentering, tarmskade eller en ubalance mellem gavnlige og sygdomsfremkaldende bakterier. Høje niveauer kan bidrage til slimhindebetændelse, inflammation og kan svække tarmslimhindens barrierfunktion. Ammoniakniveauer er en nyttig markør for mikrobiel proteinmetabolisme og intestinal sundhed.

Beta-glucuronidase er et enzym produceret af visse tarmbakterier, som kan nedbryde bindingen mellem glukuronsyre og forskellige toksiner, hormoner eller lægemidler, der er forberedt til eliminering af leveren. Forhøjet beta-glucuronidaseaktivitet i afføringen kan indikere mikrobiel ubalance og kan forstyrre afgiftning ved at reaktivere stoffer som østrogen og xenobiotika i tyktarmen. Denne reaktivering kan bidrage til systemisk toksicitet eller hormonelle ubalancer. Måling af beta-glucuronidase i afføringen hjælper med at vurdere mikrobiel metabolisme og afgiftnings-effektivitet i tarmen.

Bilophila wadsworthii er en gram-negativ, anaerob, svovlreducerende bakterie, der almindeligvis findes i den menneskelige tarm i små mængder. Den er i stand til at metabolisere galdesyrer og reducere svovlforbindelser til brintsvovl (H₂S), en gas som i overdrevne mængder kan være giftig for tarmens epitelceller og forstyrre tarmens integritet. Forhøjede niveauer af Bilophila wadsworthii er blevet associeret med inflammatoriske tilstande som colitis og kan indikere et dysbiotisk tarmlignende miljø, især som reaktion på fedtholdige eller animalske proteinrige diæter. Denne bakterie betragtes som en potentiel patobiont på grund af dens evne til at fremme inflammation under visse betingelser.

Hydrogenåndtest er et diagnostisk værktøj, der måler mængden af hydrogen i ånden, som produceres ved bakteriel fermentering i tarmene. Denne test anvendes ofte til at identificere tilstande som Small Intestinal Bacterial Overgrowth (SIBO), fruktoseintolerance og sorbitolintolerance. Forhøjede hydrogenniveauer tyder på, at ufordøjet kulhydrat bliver fermenteret af tarmbakterier, hvilket kan forårsage symptomer som oppustethed, diarré og mavesmerter.

Butyrivibrio spp. er gavnlige tarmbakterier kendt for at producere butyrat, en kortkædet fedtsyre, der spiller en central rolle i opretholdelsen af tarmens sundhed. Butyrat understøtter integriteten af tarmens slimhinde, reducerer inflammation og fungerer som en primær energikilde for kolonets celler. Tilstedeværelsen af Butyrivibrio betragtes generelt som en positiv indikator på et sundt mikrobiom. Lave niveauer kan tyde på nedsat butyratproduktion, hvilket kan være forbundet med tarmbetændelse eller dysbiose. Disse bakterier trives på kostfibre og er en del af Firmicutes-fækaliet.

Candida dubliniensis er en gærart, der er tæt beslægtet med Candida albicans og kan være en del af den normale mikrobielle flora i mave-tarmkanalen. Under visse betingelser, såsom svækket immunforsvar, dysbiose eller højt sukkerindtag, kan den formere sig kraftigt og bidrage til svampeubalance og gastrointestinale symptomer. Den er mindre almindelig end C. albicans, men deler mange lignende egenskaber, herunder evnen til at danne biofilm og forårsage slimhindelidelser. Måling af dens niveauer i afføringen hjælper med at vurdere svampeovervækst og balancen i tarmens mykobiom.

Candida glabrata er en gærart, der naturligt kan forekomme i menneskets mave-tarmkanal og genitourinære system. Mens den typisk er harmløs hos raske individer, kan den blive opportunistisk hos immunkompromitterede værter og potentielt føre til infektioner. Sammenlignet med andre Candida-arter har C. glabrata en tendens til at være mere resistent over for almindelige svampemidler. Dens overvækst i afføringsprøver kan indikere mikrobiell ubalance (dysbiose), immunsuppression eller tidligere antibiotikabehandling. Overvågning af niveauerne kan give indsigt i den generelle tarmhelse og modtagelighed for svampeovervækst.

Candida krusei er en gærart, der kan være en del af tarmens mykobiom, men som generelt forekommer i lave mængder. Den er kendt for sin naturlige resistens over for visse svampemidler, især fluconazol, hvilket gør dens identifikation klinisk relevant. En overvæxt af C. krusei kan forekomme hos personer med kompromitteret tarmflora, immunsuppression eller højt sukkerindtag. Forhøjede niveauer i afføringen kan afspejle en ubalance i mikrofloraen eller en gærsovervækst, som kan bidrage til fordøjelsesbesvær og systemiske symptomer.

Candida lusitaniae er en mindre almindelig gærart, der kan være en del af den normale flora i den menneskelige krop, men som er blevet forbundet med opportunistiske infektioner, især hos personer med svækket immunsystem. Den er bemærkelsesværdig for sin potentielle resistens over for visse svampebehandlinger, især amphotericin B. Ved afføringsanalyse kan tilstedeværelsen af C. lusitaniae indikere svampeovervækst eller dysbiose, især når den findes i forhøjede mængder. Dens påvisning er vigtig for vurdering af tarmens mikrobielle balance og kan vejlede yderligere klinisk undersøgelse, hvis det er nødvendigt.

Candida parapsilosis er en gærart, der kan være en del af den normale menneskelige mikrobiota, især på huden og i mave-tarmkanalen. Selvom den ofte er harmløs hos raske individer, kan den blive opportunistisk og forårsage infektioner, især hos hospitalsindlagte eller immunsvækkede patienter. Den er almindeligt forbundet med kateterrelaterede infektioner, sårinfektioner og nogle gange mave-tarmforstyrrelser. Forhøjede niveauer i afføringen kan indikere en ubalance i tarmens mikrobiom, nylig brug af antibiotika eller undertrykt immunsystem. Overvågning af dens tilstedeværelse kan være relevant i vurderingen af svampeovervækst eller tarmdysbiose.

Candida spp er en gruppe svampelignende gær, der kan påvirke forskellige dele af kroppen, herunder tarmen og skeden. Disse svampe forårsager ofte symptomer som kløe, ubehag og udflåd, typisk som følge af en ubalance i kroppens naturlige flora. I tarmen kan Candida spp forstyrre fordøjelsen, hvilket fører til oppustethed og ændringer i afføringsmønsteret. Faktorer som kost, generel sundhedstilstand og anvendelse af antibiotika kan bidrage til deres overvækst, og det er vigtigt at tage hånd om disse faktorer for at genoprette balancen og lindre symptomerne.

Candida tropicalis er en gærart, som kan være en del af den normale menneskelige mikrobiota, især i mave-tarmkanalen og mucosale overflader. Den har en højere patogen potentiel sammenlignet med nogle andre non-albicans Candida-arter og er ofte forbundet med systemiske infektioner hos immunkompromitterede individer. I tarmen kan forhøjede niveauer af C. tropicalis indikere svampeovervækst, dysbiose eller et svækket immunsystem. Dens tilstedeværelse ved afføringsundersøgelse kan hjælpe med at identificere ubalancer i tarmens mykobiom samt potentielle kilder til inflammation eller infektion.

Citrobacter spp. er en gruppe gramnegative bakterier, der tilhører Enterobacteriaceae-familien. De findes almindeligvis i jord, vand og tarmkanalen hos mennesker og dyr. Mens nogle arter er en del af den normale tarmflora i små mængder, kan forhøjede niveauer indikere dysbiose eller overvækst. Visse arter, såsom Citrobacter freundii, har været forbundet med mave-tarmforstyrrelser, urinvejsinfektioner og hospitalsrelaterede infektioner hos sårbare personer. Ved afføringsprøver kan tilstedeværelsen af Citrobacter afspejle mikrobiologisk ubalance, immunstress eller tidligere antibiotikabrug.

Coprococcus spp. er gavnlige bakterier i den menneskelige tarmmikrobiom, der tilhører Firmicutes-filosofien. Disse mikrober er kendt for deres evne til at producere butyrat, en kortkædet fedtsyre, som understøtter tarmens barriereintegritet, modulerer inflammation og fremmer generel fordøjelses sundhed. Højere niveauer af Coprococcus er ofte forbundet med en velafbalanceret mikrobiom og forbedret mental velvære, da butyrat også kan påvirke hjernens sundhed via tarm-hjerne-aksen. Lave niveauer kan afspejle dårlig fiberfermentering, tarmdysbiose eller inflammation. Deres tilstedeværelse betragtes generelt som en markør for en sund, fiber-rig kost.

D-arabinitol er en sukkeralkohol, der bruges som biomarkør i kroppen til at hjælpe med at opdage Candida-infektioner. Forhøjede niveauer af D-arabinitol indikerer ofte en overvækst af Candida, især hos immunkompromitterede personer. Måling af D-arabinitol giver en hurtigere og mindre invasiv måde at diagnosticere systemisk candidiasis på sammenlignet med traditionelle dyrkningsmetoder.

Desulfomonas pigra er en art af sulfat-reducerende bakterier (SRB), der findes i anaerobe miljøer, herunder den menneskelige tarm. Den spiller en rolle i svovlmetabolismen ved at reducere sulfat til brintsvovl (H₂S). Selvom brintsvovl er en naturligt forekommende forbindelse i tyktarmen, kan forhøjede niveauer produceret af SRB’er som D. pigra forstyrre tarmbarrierens funktion og bidrage til gastrointestinale inflammationer eller ubehag. En øget forekomst af Desulfomonas pigra kan indikere en overvækst af svovl-reducerende mikroorganismer, hvilket potentielt er forbundet med kostvaner rige på svovlholdige fødevarer eller ubalancer i tarmens mikrobiota.

Desulfovibrio piger er en almindelig sulfatreducerende bakterie (SRB) i den menneskelige tarmmikrobiota. Den reducerer sulfat og andre svovlforbindelser til brint sulfid (H₂S), en gas, der i små mængder spiller fysiologiske roller, men i overskud kan være giftig for tarmceller. Forhøjede niveauer af D. piger er blevet forbundet med gastrointestinale lidelser såsom inflammatorisk tarmsygdom (IBD) og irritabel tyktarm (IBS). Dens forekomst kan afspejle øget svovlindtag gennem kosten eller en forstyrret mikrobiologisk balance, der favoriserer svovlmetabolisme.

Diamin oxidase (DAO) er et enzym, der hjælper med at nedbryde histamin, en forbindelse, der er involveret i immunsystemets funktion, fordøjelse og nervesystemets aktivitet. Sundt DAO-niveau er vigtigt for at regulere histaminbalancen og reducere risikoen for histaminintolerance.

Dysbioseindekset er et mål, der bruges til at vurdere graden af ubalance i tarmens mikrobiom og angiver tilstedeværelsen og sværhedsgraden af dysbiose. Det kvantificerer afvigelser i mikrobiens mangfoldighed og sammensætning sammenlignet med en sund referencepopulation. Et højere indeks tyder på en større dysbiose, hvilket kan være forbundet med helbredsproblemer som inflammation, fordøjelsesforstyrrelser eller metaboliske tilstande.

Pancreatic elastase er et enzym, der produceres af bugspytkirtlen og spiller en central rolle i fordøjelsen af proteiner. Måling af dets niveau i afføring kan give vigtige indsigter i bugspytkirtlens funktion. Da enzymet forbliver stabilt i afføringsmateriale, fungerer det som en pålidelig markør til vurdering af bugspytkirtlens exokrine funktion, især ved diagnosticering af pancreatisk insufficiens.

Enterotyper er klassifikationer af den menneskelige tarmmikrobiom baseret på de dominerende bakteriegrupper og deres metaboliske funktioner. Der findes tre hovedenterotyper: Bacteroides-dominerende (Type 1), Prevotella-dominerende (Type 2) og Ruminococcus-dominerende (Type 3). Hver type har unikke karakteristika i, hvordan næringsstoffer som fedtstoffer, kulhydrater og proteiner metaboliseres. For eksempel er Prevotella (Type 2) mere effektiv til at udnytte kulhydrater, især ved fiberrige kostvaner, men mindre i stand til at syntetisere visse vitaminer. Din enterotype kan påvirke næringsoptagelsen, tarmens sundhed og hvordan din krop reagerer på forskellige typer diæter.

Equol er en forbindelse, der produceres af tarmbakterier under nedbrydningen af soja-isoflavonet daidzein. Det fungerer som en non-steroid østrogen og kan have forskellige sundhedsmæssige fordele, herunder antioxidante og hormonbalancerende effekter. Dog er det kun nogle individer, der huser de specifikke tarmbakterier, som er i stand til at producere equol. Måling af equol i afføringen hjælper med at afgøre, om tarmens mikrobiom effektivt kan omdanne daidzein, hvilket giver indsigt i mikrobiel diversitet og funktion relateret til østrogenmetabolisme.

Eubacterium spp. er en mangfoldig gruppe af anaerobe bakterier, der findes i den menneskelige tarm og er klassificeret inden for Firmicutes-fylumet. Mange arter inden for denne slægt spiller en gavnlig rolle i at opretholde tarmens sundhed ved at producere kortkædede fedtsyrer (SCFA'er), især butyrat. Disse forbindelser hjælper med at nære tarmcellerne, understøtte immunsystemets funktion og reducere inflammation. Nogle arter kan også være involveret i galdesyremetabolisme og vitaminsyntese. En ubalance i Eubacterium-populationerne kan være forbundet med dysbiose eller kroniske gastrointestinale tilstande.

Faecalibacterium prausnitzii (F. prausnitzii) er en vigtig gavnlige bakterie i den menneskelige tarm, kendt for sine antiinflammatoriske virkninger. Den spiller en væsentlig rolle i at opretholde tarmens sundhed ved at støtte en afbalanceret mikrobiom og styrke tarmbarrieren.

Fenoler er organiske forbindelser, der kan produceres af tarmbakterier under fermenteringen af visse aminosyrer, især tyrosin. Nogle fenoler, såsom p-cresol, kan have toksiske virkninger i høje koncentrationer og er forbundet med dysbiose eller ubalancer i tarmens mikrobiota. Forhøjede niveauer af fenoler i afføringen kan afspejle mikrobiologisk aktivitet, som kan belaste leverens afgiftssystemer. Overvågning af fenoler hjælper med at vurdere, hvor godt tarmen håndterer proteinnedbrydning og mikrobiel fermenteringsproces.

Firmicutes er en af de store bakteriephyla i den menneskelige tarmmikrobiom og omfatter mange arter, der er involveret i energiudvinding fra mad. Disse bakterier er effektive til at nedbryde komplekse kulhydrater og producere kortkædede fedtsyrer, som kan understøtte tarm- og metabolisk sundhed. En uforholdsmæssigt høj ratio af Firmicutes i forhold til Bacteroidetes er dog i nogle studier blevet sat i forbindelse med fedme og metaboliske forstyrrelser. Balancen af Firmicutes er derfor en vigtig markør for vurdering af mikrobiel diversitet og potentielle metaboliske tendenser. De individuelle sundhedseffekter afhænger af den samlede sammensætning og værtens faktorer.

Fusobacterium er en slægt af anaerobe, gramnegative bakterier, der naturligt findes i den menneskelige mundhule, mave-tarmkanalen og nogle gange i vaginalfloraen. Mens nogle arter kan være en del af en normal mikrobiom, er Fusobacterium også kendt for sin forbindelse til inflammation og infektion. Høje niveauer i tarmen er blevet koblet til tilstande som inflammatorisk tarmsygdom (IBD) og kolorektal kræft. Dets tilstedeværelse betragtes ofte som en markør for mikrobiel ubalance eller patogen overvækst, især når det findes sammen med symptomer som oppustethed eller ændrede afføringsvaner.

Gær er en type svamp, der naturligt findes i den menneskelige krop, især i tarmen og på huden. I normale mængder er den harmløs og en del af det sunde mikrobiom. Dog kan en ubalance føre til overvækst, hvilket kan forårsage forskellige sundhedsproblemer. Faktorer som kost, brug af antibiotika og den generelle helbredstilstand kan påvirke gæreniveauerne.

Galdesyrer er forbindelser, der er essentielle for fordøjelsen af fedtstoffer, produceret i leveren og opbevaret i galdeblæren. Mens de fleste genoptages i kroppen, udskilles en del med afføringen. Måling af galdesyrer i afføringen hjælper med at vurdere fordøjelsessundheden, især ved diagnosticering af fedtmalabsorption og relaterede tilstande.

Geotrichum candidum er en svamp, der almindeligvis findes i miljøet, herunder jord, vand, luft og visse fødevarer. Den er også en naturlig del af den menneskelige mikrobiota og findes typisk i tarmen og på huden. Selvom den som regel er harmløs, kan den blive opportunistisk og forårsage infektioner hos personer med svækket immunsystem.

Histamin (Afføring) er en diagnostisk markør, der anvendes til at vurdere allergisk og inflammatorisk aktivitet i mave-tarmkanalen. Histamin er en biogen amin, der frigives af immunceller som reaktion på allergener og spiller en central rolle i inflammation. Forhøjede niveauer af histamin i afføringen kan indikere tilstande som madallergi, inflammatorisk tarmsygdom (IBD) eller mastcelleaktivering og bidrager til at styre diagnose og behandling af relaterede immunresponser.

Histaminproducerende bakterier er tarmmikrober, der er i stand til at omdanne aminosyren histidin til histamin, en biogen amin, der spiller en central rolle i immunresponser og allergiske reaktioner. Selvom histamin er et nødvendigt signalstof, kan overskydende produktion i tarmen bidrage til symptomer, der minder om allergier, såsom udslæt, hovedpine eller fordøjelsesubehag. Disse bakterier kan trives i nærvær af kronisk stress, dårlig tarmbarrierefunktion eller kost rig på histidinholdige fødevarer. Forhøjede niveauer er forbundet med tilstande som histaminintolerance eller pseudoallergier. At opretholde en balanceret mikrobiom og en sund tarmbarriere kan hjælpe med at reducere histaminbelastningen fra mikrobielle kilder.

Indoxylsulfat er et uræmisk toxin, der dannes, når tarmbakterier nedbryder aminosyren tryptofan til indol, som derefter absorberes og omdannes til indoxylsulfat i leveren. Mens små mængder normalt udskilles via nyrerne, kan forhøjede niveauer indikere nedsat afgiftning, dysbiose eller nyrestress. Indoxylsulfat har været forbundet med oxidativt stress, systemisk inflammation og vaskulær dysfunktion – især hos personer med nedsat nyrefunktion. Det fungerer som en markør for både mikrobiologisk aktivitet og kroppens evne til at bearbejde og eliminere metabolisk affald.

Calprotectin er et protein, der findes i hvide blodlegemer og fungerer som en markør for inflammation, især i tarmen. Måling af calprotectinniveauer i afføringen hjælper med at vurdere graden af tarmbetændelse. Denne test er nyttig til at diagnosticere og overvåge inflammatoriske tarmsygdomme (IBD) såsom Crohns sygdom og colitis ulcerosa samt til at skelne dem fra irritabel tyktarm (IBS), som typisk ikke medfører forhøjede calprotectinniveauer.

Afføringsfedttesten er en diagnostisk metode, der kvantificerer mængden af fedt udskilt i afføringsprøver. Den anvendes til at vurdere fedtabsorption og til at påvise malabsorptionssyndromer. Forhøjede fedtniveauer i afføringen, kendt som steatorrhea, kan indikere fordøjelses- eller absorptionsproblemer i mave-tarmkanalen. Denne test hjælper med at diagnosticere tilstande såsom pankreasinsufficiens, cystisk fibrose, cøliaki og Crohns sygdom.

Den kvantitative bestemmelse af kvælstof (N) er en laboratorietest, der måler kvælstofniveauer i kropsudskillelser, typisk urin eller afføring, for at vurdere proteinfordøjelse og -absorption. Denne test er vigtig for at evaluere ernæringstilstanden, især i kliniske omgivelser, hvor protein-energimalnutrition eller ubalancer kan være en bekymring. Den giver væsentlige indsigter i metaboliske funktioner relateret til proteinomsætning og kan hjælpe med at diagnosticere tilstande, der påvirker proteinmetabolismen, herunder nyresygdomme, malabsorptionssyndromer og visse stofskiftesygdomme.

Den kvantitative afførings-sukker test er et diagnostisk værktøj, der måler mængden af specifikke sukkerarter i afføringen for at vurdere kulhydratmalabsorption. Den hjælper med at identificere tilstande som laktoseintolerans, fruktoseintolerans og andre lidelser, der påvirker sukkerfordøjelse og -absorption. Ved at påvise ufordøjet sukker som laktose, fruktose eller sorbitol i afføringen hjælper denne test sundhedsudbydere med at pinpoint, hvilke sukkerstoffer fordøjelsessystemet har vanskeligheder med at nedbryde, ofte forbundet med symptomer som oppustethed, gas, diarré og mavesmerter.

Analysen af indholdet af vand i afføring er en test, der måler mængden af vand i fæces. Denne vurdering er vigtig for diagnosticering af tilstande relateret til unormal vandabsorption eller -sekretion i mave-tarmkanalen. Den hjælper med at identificere årsager til diarré, som kan skyldes infektioner, inflammatoriske tarmsygdomme (IBD), irritabel tarmsyndrom (IBS) eller malabsorptionssyndromer, hvor der enten er overdreven vandsekretion eller utilstrækkelig absorption i tarmene.

Mangfoldighed refererer til variationen af bakteriearter til stede i tarmens mikrobiom. En højere mikrobiologisk mangfoldighed er generelt forbundet med bedre fordøjelsessundhed, immunfunktion og modstandsdygtighed over for patogener. Lav mangfoldighed kan derimod være forbundet med inflammation, dårlig næringsabsorption og forskellige kroniske sygdomstilstande.

Methanåndedrætstest er en diagnostisk metode, der måler mængden af methangas produceret af tarmbakterier. Methan dannes af specifikke tarmmikrober under fermenteringen af visse kulhydrater. Forhøjede methanniveauer i åndedrætstests er forbundet med tilstande som Small Intestinal Bacterial Overgrowth (SIBO), fruktoseintolerance og sorbitolintolerance, som kan forårsage symptomer som oppustethed, forstoppelse, mavesmerter og ændringer i afføringsvaner.

Methanobrevibacter-arter er arkæer—mikroorganismer, der adskiller sig fra bakterier—og som primært lever i den menneskelige tarm. Disse mikrober er kendt for at producere metangas som et biprodukt af fermentation, især fra brint og kuldioxid. Forhøjede niveauer af Methanobrevibacter spp. er blevet forbundet med langsommere tarmtransit og symptomer som forstoppelse og oppustethed. I modsætning til mange bakterier påvirkes arkæer ikke af standardantibiotika, hvilket gør overvækst sværere at håndtere. Deres tilstedeværelse giver indsigt i balancen i mikrobielle fællesskaber og gasproduktion i tarmen.

Morganella spp., især Morganella morganii, er gramnegative bakterier, der tilhører familien Enterobacteriaceae. De betragtes som opportunistiske patogener og findes lejlighedsvis i den menneskelige tarm som en del af den normale flora. Forhøjede niveauer i afføringen kan dog indikere dysbiose eller potentiel infektionsrisiko, især hos immunkompromitterede individer. Morganella er også kendt for sin produktion af biogene aminer, såsom putrescine og cadaverin, som kan bidrage til symptomer i tarmen og systemiske symptomer. I kliniske sammenhænge er Morganella morganii blevet forbundet med urinvejsinfektioner og andre hospitalsrelaterede infektioner.

Fækal okkult blod (FOB) er en måling, der opdager skjult blod i afføringen, som ikke er synligt for det blotte øje. Tilstedeværelsen af FOB kan være en vigtig indikator på intern gastrointestinal blødning, som ofte forekommer uden åbenlyse symptomer. FOB-testning er en ikke-invasiv metode, der anvendes til at hjælpe med at identificere potentielle underliggende medicinske tilstande, der påvirker fordøjelsessystemet.

Stol-pH-værdien er et mål, der angiver surhedsgraden eller alkaliniteten i tarmene. Den afspejler balancen i metaboliske processer såsom fermentering og nedbrydning af proteiner. En lav stol-pH tyder ofte på øget fermentering af komplekse sukkerarter af tarmbakterier, hvilket kan gøre afføringen mere sur. Omvendt kan en høj stol-pH skyldes overdreven proteinmetabolisme, hvilket fører til produktion af ammoniak og andre forbindelser, der hæver stol-pH-niveauet.

Proteobacteria er en stor række gramnegative bakterier, der omfatter både harmløse kommensaler og potentielle patogener. I tarmen kan en lille mængde Proteobacteria være normal, men forhøjede niveauer betragtes ofte som en indikator for dysbiose og inflammation. Denne gruppe inkluderer arter som Escherichia, Salmonella, Helicobacter og Klebsiella, hvoraf nogle er forbundet med mave-tarm-lidelser, infektioner og metaboliske ubalancer. En øget forekomst af Proteobacteria kan afspejle mikrobiologisk ustabilitet eller et proinflammatorisk tarmmiljø.

Providencia spp. er gramnegative, fakultativt anaerobe bakterier, der tilhører Enterobacteriaceae-familien. De er normalt ikke dominerende medlemmer af tarmens mikrobiom, men kan findes i små mængder. Nogle arter, såsom Providencia stuartii og Providencia rettgeri, betragtes som opportunistiske patogener og er blevet forbundet med urinvejsinfektioner og gastrointestinale forstyrrelser. Forhøjede niveauer i en afføringsprøve kan indikere mikrobiologisk ubalance (dysbiose) eller en overrepræsentation af potentielt patogene stammer. Providencia-arter er også kendt for deres evne til at producere urease og bidrage til dannelsen af ammoniak.

Roseburia spp. er gavnlige, anaerobe bakterier, der tilhører phylum Firmicutes og er almindelige indbyggere i den sunde menneskelige tarm. Disse bakterier er kendt for deres evne til at producere butyrat, en kortkædet fedtsyre, som fungerer som en vigtig energikilde for colonocytter og hjælper med at reducere betændelse i tarmen. Et velafbalanceret niveau af Roseburia er ofte forbundet med bedre metabolisk sundhed, forbedret tarmbarrierefunktion og lavere risiko for inflammatoriske lidelser. Nedsatte niveauer er blevet koblet til tilstande såsom fedme, type 2-diabetes og inflammatorisk tarmsygdom.

Ruminococcus spp. er en gruppe af anaerobe bakterier inden for phylum Firmicutes, som almindeligvis findes i den menneskelige tarmmikrobiota. De spiller en væsentlig rolle i fermenteringen af komplekse kulhydrater og produktionen af kortkædede fedtsyrer som acetat og butyrat, som understøtter tarmens sundhed og energimetabolismen. Ruminococcus-arter anses for at være vigtige for at opretholde et balanceret tarmligevægt, især på grund af deres evne til at nedbryde fibre. Ændrede niveauer af Ruminococcus har været forbundet med fordøjelsesproblemer, irritabel tarm-syndrom (IBS) og stofskiftesygdomme.

Niveauet af sekretorisk IgA (sIgA) afspejler mængden af et vigtigt immunprotein kaldet Immunoglobulin A, som hovedsageligt findes i slimhindområder såsom tarmene, luftvejene og spyt. Sekretorisk IgA spiller en afgørende rolle i kroppens første forsvarslinje ved at binde sig til patogener og forhindre deres indtrængen, hvilket hjælper med at beskytte slimhinderne og understøtte den samlede immun- og tarmhelse.

Sekundære galdesyrer dannes i tyktarmen gennem bakteriel omdannelse af primære galdesyrer, der oprindeligt er syntetiseret i leveren. Selvom de spiller en rolle i fordøjelsen og mikrobiologisk regulering, kan forhøjede niveauer signalere dysbiose, et overdrevet fedtindtag eller ændret galdesyrestofskifte. Nogle sekundære galdesyrer, som deoxycholsyre (DCA) og lithocholsyre (LCA), er blevet forbundet med slimhindirritation, inflammation og øget risiko for colorectal sygdomme ved vedvarende forhøjede niveauer. Måling af dem i afføringen hjælper med at vurdere tarmens mikrobielle aktivitet og status for galdesyredetoxificering.

Trimethylamin (TMA) er et metabolit, der produceres af tarmbakterier under nedbrydningen af cholin, carnitin og lecithin – næringsstoffer, der almindeligvis findes i kød, æg og mejeriprodukter. I leveren omdannes TMA til Trimethylamin N-oxid (TMAO), en forbindelse, der i flere studier har været forbundet med øget risiko for hjerte-kar-sygdomme. Forhøjede niveauer af TMA/TMAO kan afspejle høj mikrobiel omsætningsaktivitet i tarmen, ubalance i mikrobiotaen eller en kost rig på animalske produkter. Selvom forskningen fortsætter, er højt TMAO blevet sat i forbindelse med inflammation og forstyrret kolesterolmetabolisme. En balanceret tarmflora og plantebaserede kostvaner kan hjælpe med at opretholde sunde TMAO-niveauer.

Zonulin er et protein, der regulerer permeabiliteten af tight junctions mellem celler i fordøjelseskanalen. Det spiller en central rolle i opretholdelsen af den intestinale barriere ved at kontrollere passage af stoffer, såsom næringsstoffer og antistoffer, fra tarmen til blodbanen. Ubalance i zonulin-niveauer kan påvirke tarmens permeabilitet og potentielt bidrage til forskellige helbredsproblemer.